早前於日本應用普及度極高，創立於 2014 年用戶人數達 4,400 萬的 LINE Pay，在無預警下公布於 2025 年 4 月完全退出當地市場。其最大原因是「讓路」予同一企業集團下的 PayPay，於未來專注發展日本國內的轉帳與電子支付相關服務。現時日本 LINE Pay 用戶需把現有結餘在限期前轉到 PayPay 以繼續使用。
在此之前，PayPay 早於 2018 年由 Yahoo! 日本和軟銀合作創立，同樣主攻二維碼（QR Code）支付科技，在 2021 年 LINE 與 Yahoo!日本合併後，其實兩者已能共享二維碼於商戶支付結帳。近年 PayPay 在積極與包括支付寶在內的大中華區二維碼支付科技商合作，讓旅客遊日時能於部分商戶，直接以本國手機 App 結帳，也令品牌的國際知名度大增。
若以宏觀角度分析，有關決策其實來得太遲。原因是在於 2021 年起，LINE 已與 Yahoo! 日本完成合併，隨後在 2023 年 9 月，管理層最於決定把兩者歸入同一母公司，並改名為「LY Corporation」，即由韓國 Naver 與日本軟銀（Softbank）合資設立的企業，直至 2024 年這刻方決心處理市場重疊問題，已經拖延接近 3 年時間。